2013-01-01から1年間の記事一覧

IPIからEntrez Gene IDへの変換

未だにIPI IDを使用しているデータが散見される。既にIPIのメンテナンスは終わっているのに...。 IPIの最後のバージョンのデータベース参照テーブルをダウンロードするのが手っ取り早いかも知れない。以下、ヒトのデータ。 ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/database…

年末のスイーツ

昨年の年末も同じ店でこんなもの食べてたなぁ~

男女の違い

納得できるものも多数... http://vivas.fi/what-is-the-difference-between-women-and-men-3/

subversionで削除したファイルの復元

ワーキングディレクトリで svn cp https://xxx.xxx.xxx.ac.jp/repos1/MyFolder/myfile1@376 ./ 但し、376はrevision numberの例。revision numberは svn log -v で確認できる。

Adobe Creative Suite (Illustrator)のSnow Leopardへのインストール

1. "Adobe Creative Suite"(インストーラ)をデスクトップにコピーする 2. 右クリックで"パッケージの内容を表示" 3. "Contents" → "Resources" → "sub installers"フォルダを開く。 4. "IllustratorCS ja_JP"を右クリックで、"パッケージの内容を表示" 5. "C…

Python GUIデザインツール

Visual Basic、Visual C++、MATLAB等の商用ソフトにはGUIデザインやGUIプログラミングができるGUIベースの開発環境がついている。ではPythonでは? Python GUI designやPython GUI builderといったキーワードでgoogle検索をするのがいいだろう。 見つかった…

San Diego近辺でHappy Hour Wineが安く飲める店

Recommended restaurants for Happy Hour Wines around San Diego area Mia Francesca http://www.miafrancesca.com 12955 El Camino Real G-4 San Diego, CA 92130 (858) 519-5055 Pummarò http://www.pummaropizzeria.com/ 1101 Scott St San Diego, CA 92…

Python: __getattr__メソッド付きのオブジェクトでcPickleで保存

class TestClass1: def __init__(self, h): self.h = h def __getattr__(self, attrname): return getattr(self.h, attrname) これだと、 testc = TestClass1({"Apple": "Ringo", "Orange": "Mikan"}) print testc.keys() print testc.values() fh = open("/…

Rパッケージのソースからのインストール(Mac OS X Mavericks, Xcode 5.0.2)

make: llvm-gcc-4.2: No such file or directory のようなエラーが出るようであれば、/Library/Frameworks/R.framework/Resources/etc/Makeconfの該当2行を以下のように書き換える。 CC=clang CXX=clang++

macports: データを最新のものに更新

sudo port -v selfupdate 特にmacportsのインストール直後はこれをやらないと、取得できないソフトがあったりする。

R言語 - 行列から列ベクトル抽出時に行ベクトルになるのを避ける

drop = Fを使う。 > tmpmat1 <- matrix(1:12, nrow=3) > tmpmat1 [,1] [,2] [,3] [,4] [1,] 1 4 7 10 [2,] 2 5 8 11 [3,] 3 6 9 12 > tmpmat1[,2] [1] 4 5 6 > tmpmat1[,2, drop=F] [,1] [1,] 4 [2,] 5 [3,] 6 >

Subversionで特定のファイルを古いバージョンに戻す方法

% svn log path_to_file # 特定のファイルのrevision historyを表示 ------------------------------------------------------------------------ r5005 | golgo8128 | 2013-11-12 10:58:38 -0800 (Tue, 12 Nov 2013) | 1 line Updating analyzer. ---------…

Mac OS X Mavericksの起動時環境変数設定

/etc/launchd-user.conf というファイルを作って以下のように記述。 # User-defined environmental variables for non-shell based applications setenv MATLAB_UDATA_RDIR /Users/golgo8128/UNIX/Work/Research pathの設定なら、 /etc/paths にpathを書き込…

Mac ドライブイメージのダウンロードの失敗回避策

システム環境設定→セキュリティとプライバシーで、全てのダウンロードしたアプリケーションの実行許可を一時的に有効にする。

MacでTeX

MacTEXをダウンロードしインストール。 http://tug.org/mactex/ 次に以下のコマンドを実行。 sudo mkdir -p /usr/local/texlive/texmf-local/fonts/opentype/public/hiragino/ cd /usr/local/texlive/texmf-local/fonts/opentype/public/hiragino/ sudo ln -…

Mac OS X Finderで任意のフォルダに移動する

Cmd + Shift + gでフォルダーパス入力欄が開く。プルダウンメニューを使うなら、移動→フォルダーへ移動でもよい。

Adobe ReaderでPDFに画像を貼り付け

クリップボードの画像をスタンプとして使えそうだ。すなわち、ペイントソフト等の画像をコピーし、スタンプメニューから、「クリップボード画像をスタンプとして貼り付け」を選ぶ。

ipad 2の自力バッテリー交換

こちらはハードルが高そうだ。 日本語: http://www.ipad-repair.jp/koukai/ipad2/ 英語: http://www.ifixit.com/Guide/iPad+2+Wi-Fi+EMC+2415+Battery+Replacement/5383

MacBook Air Mid 2009 自力でバッテリー交換できるか

まずはMacBook Air Mid 2009 技術資料から: http://support.apple.com/kb/SP548?viewlocale=ja_JP&locale=ja_JP MacBook Airのバッテリー交換に関する日本語記事: http://blog.inmycab.com/macintosh/15422/ MacBook Air Mid 2009 バッテリー交換方法: http:…

文献管理・引用ソフト

EndNoteが伝統的だが、有料。 フリーではzoteroが使えそうだ。 http://www.zotero.org

サン・ディエゴ帰還の日

雨の湘南台から。 成田→サン・ディエゴ直行便。

2年半ぶり東山散策

東山中学校前。 danton美容室前の通り。 246。

こちらは田園都市線

池尻大橋駅。 商店街に出る。

都心の地下鉄の典型的な光景

銀座線。これだけでも日本に帰って来たなぁ、という感じになる。

Mac (UNIX)でデスクトップにソフトウェアリンクを貼る方法

例: $ cd ~/Desktop $ ln -s ~/ username $ ln -s ~/Documents/my_trunk . $ ln -s ~/Sites/my_web_page .

Mac X11 バックスラッシュの入力

1. X11の環境設定で、"システムのキーボードレイアウトに従う"を無効にする 2. echo "keycode 101 = backslash bar" > ~/.Xmodmap 3. X11を再起動。

一時帰国中のインターネット接続環境

少なくとも小田急線沿線には以下のようなサービスが結構使えるようだ。 https://service.wi2.ne.jp/ その他、モバイルWiFiルータをレンタルする手段もあるようだ。

週刊誌にワトソン博士のインタビュー

帰国後、日本の情報を仕入れるために、まずは低俗な(?)週刊誌を購入。どこまで鵜呑みしていいか、分からないが、ワトソン博士の興味深いインタビュー記事が載っていたので、メモしておこう。 週間現代 2013 9・21/28 p.162-165 「世界の知性」に聞く 第3回 …

帰国早々湘南台

成田空港から湘南台へ。早速かー そして昨日も湘南台へ...。

出発の朝、海を越えて...

家族のために一時帰国を決断。清清しいサンディエゴの朝、二年半ぶりの日本へ出発だ。