Pythonによるグラフ解析

理工 #生物学
研究室の大学院生アンディー・グロス君はPython使いの一人だ。彼はグラフ理論を使って疾患の解析に取り組んでいる。彼は優秀な大学院生の一人でもある。

先日彼が作ったプログラムを提供して頂いた。彼はこんなパッケージを使っていた。

numpy
scipy
networkx
matplotlib
pandas
rpy2
igraph

#R Package Dependencies
igraph
dynamicTreeCut